Am Lehrstuhl für Modellierung und Simulation biologischer Prozesse der Fakultät für Angewandte Informatik der Universität Augsburg ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt die Stelle für eine/einen

Akademische Oberrätin / Akademischen Oberrat (m/w/d) auf Zeit als
Leitung Serviceeinheit - Einzelzell-RNA-Sequenzierungen
 

im Umfang der regelmäßigen Arbeitszeit in einem für vier Jahre befristeten Beamtenverhältnis zu besetzen. Die Besoldung erfolgt bei Vorliegen der beamten- und laufbahnrechtlichen Voraussetzungen in Besoldungsgruppe A14, möglicherweise auch in Teilzeit.

Die Forschung am Lehrstuhl für Modellierung und Simulation biologischer Prozesse zielt darauf ab, quantitative Systemmodelle mit KI/Machine Learning zu verknüpfen, um neuartige therapeutische Strategien für die Krebs und andere Krankheiten zu entdecken. Mit einem Fokus auf Deep-Learning-Techniken streben wir an, groß angelegte Datensätze nahtlos mit Patientenergebnissen zu integrieren, um dadurch komplexe Krankheitsdynamiken und therapeutische Reaktionen zu entschlüsseln. Dabei verwenden wir innovative Technologien wie Einzelzellsequenzierung und Deep Learning, um die Komplexität der Krankheitsbiologie zu enträtseln und klinisch relevante Erkenntnisse zu gewinnen.

Die Serviceeinheit - Einzelzell-RNA-Sequenzierungen leistet digitale Analysearbeit, d.h. Einbringung, Prozessierung und Annotierung von Datensätzen aus Einzelzell-RNA-Sequenzierungen, wie sie z.B. im Profilzentrum Tumormedizin generiert werden oder in interdisziplinärer Verbundprojekte mit anderen klinischen Profilzentren durchgeführt werden.

Wir fördern die interdisziplinäre Zusammenarbeit durch offene Kommunikation und Karriereplanung, um sicherzustellen, dass Wissenschaftler aus verschiedenen Bereichen produktiv zusammenarbeiten können.

Ihr Aufgabengebiet:

• Aufbau und Leitung der Serviceeinheit - Einzelzell-RNA-Sequenzierungen
• Aufbau einer computergestützten Infrastruktur, die der nachhaltigen Datenanalyse und auch der Entwicklung von Tools und Methoden dient, die Speicherung großer Datensätze und die gleichzeitige Abfrage mehrerer Datensätze und biomedizinische Datenanalysen ermöglicht.
• Interne und externe Repräsentation und Bewerbung der Serviceeinheit, Verwaltung des Webauftrittes und externer Serviceprovider, und idealerweise Mithilfe bei der Einwerbung zusätzlicher Drittmittelfinanzierung.
• Koordination von Projektsupport, nach Bedarf sowie die Unterstützung technischer Projektberichte, nach Bedarf. 
• Teilnahme an der Erstellung hochwertiger wissenschaftlicher und/ oder technischer Arbeiten, die für die Veröffentlichung in renommierten Fachzeitschriften und für die Präsentation auf nationalen und internationalen Konferenzen geeignet sind.
• Coaching, Mentoring und direkte Anleitung von technischem Personal, Studierenden und Nachwuchswissenschaftlern zum Import, Bereinigung und Integration von Datensätzen für computergestützte Analysen, Mithilfe beim Team Building
• Sie halten sich über neu veröffentlichte Methoden des Machine Learnings und der Einzelzell-RNA-Sequenzierungen auf dem Laufenden.
• Planen und Durchführen von Lehrveranstaltungen und Unterstützung der Aufgaben der akademischen Selbstverwaltung des Lehrstuhls, gemäß BayHIG.

Ihr Profil:

• Eine abgeschlossene Habilitation oder gleichwertige Qualifikationen in relevanten Themenbereichen wie zum Beispiel Systems Biology, Computational Biology, Data Science, Physik, Informatik, Ingenieurwesen, Statistik, Mathematik.
• Ein Nachweis wissenschaftlicher Innovation und Kreativität sowie die Fähigkeit und Bereitschaft, neuartige Ideen und Ansätze in wissenschaftliche Untersuchungen einzubeziehen, idealerweise durch entsprechende Publikationen belegt.
• Vorzugsweise Erfahrung in der Analyse von Bulk- und single-cell RNA Sequencing, dem Aufbau, der Bewertung und dem Einsatz von Deep-Learning-Modellen (Autoencoder, GANs, etc.) die durch abgeschlossene Projekte nachgewiesen werden. Sicherheit bei der Durchführung von computergestützten Analysen, Fehlerbehebung und Dokumentation.
• Programmierkenntnisse, zum Beispiel mit Python (bevorzugt), MATLAB oder R, solide Kenntnis der Best Practice für Programmierung.
• Sehr gute schriftliche und mündliche Kommunikationsfähigkeiten in Englisch, einschließlich der Fähigkeit, Forschungsergebnisse zu veröffentlichen, Berichte zu erstellen und die Ergebnisse wissenschaftlicher Untersuchungen auf nationalen und internationalen Konferenzen und Stakeholder-Treffen zu präsentieren.
• Die Fähigkeit, als Teil eines multidisziplinären Forschungsteams sowie mit externen Forschern, auch international, effektiv zu arbeiten und unabhängige individuelle Forschung durchzuführen, um zu gemeinsamen Forschungszielen der Arbeitsgruppe und des Projektteams beizutragen
• Aufgeschlossenheit, Teamfähigkeit, Flexibilität sowie die Fähigkeit zu selbstständigem und eigenverantwortlichem Arbeiten
• Loyalität, Verlässlichkeit und hohe Vertrauenswürdigkeit
• sicherer Umgang mit Internet, E-Mail und den aktuellen Office-Anwendungen (Word, PowerPoint, Excel) sowie die Bereitschaft, sich hier weiterzubilden

Wir bieten:

• einen attraktiven und sicheren Arbeitsplatz,
• ein interessantes und abwechslungsreiches Aufgabengebiet im dynamischen, multikulturellen Umfeld einer Universität,
• Möglichkeiten zu eigenständigem Arbeiten und der Leitungsfunktion in einem engagierten Team,
• eine offene und wertschätzende Arbeitsatmosphäre mit persönlichem Arbeitsplatz,
• eine familienfreundliche Arbeitszeitgestaltung mit Homeofficeregelungen und gleitenden Arbeitszeiten,
• umfangreiche Förderung von Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten,
• Jahressonderzahlungen und
• die Möglichkeit, verschiedene universitäre Einrichtungen zu nutzen (z.B. Hochschulsport, Gesundheitsförderung, Sprachkurse)

Die erforderliche Qualifikation ist bereits in den Bewerbungsunterlagen durch entsprechende Zeugnisse nachzuweisen.

Die Universität Augsburg fördert die berufliche Gleichstellung von Frauen. Frauen werden ausdrücklich aufgefordert, sich zu bewerben. Die Universität Augsburg setzt sich besonders für die Vereinbarkeit von Familie und Erwerbsleben ein. Für mehr Informationen wenden Sie sich bitte an die Frauenbeauftragte der Fakultät.

Schwerbehinderte Bewerberinnen und Bewerber (m/w/d) werden bei ansonsten im Wesentlichen gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt eingestellt.

Haben wir Ihr Interesse geweckt? Dann freuen wir uns über Ihre aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen (Motivationsschreiben, Lebenslauf) bitte nur per E-Mail in Form einer einzigen PDF-Datei bitte bis spätestens

31. September 2024

an:
Prof. Dr. Andreas Raue
Professur für Modellierung und Simulation biologischer Prozesse
Universität Augsburg
Gutenbergstr. 7
86356 Neusäß
E-Mail: andreas.raue@uni-a.de