In dieser Fördersäule werden besonders innovative interdisziplinäre wissenschaftliche Projekte aus allen klinischen, klinisch-theoretischen und grundlagenmedizinischen Fachbereichen gefördert. Die strategischen Zielsetzungen der intramuralen Forschungsförderung müssen erfüllt sein. Gefördert werden können:

• Besonders innovative, interdisziplinäre wissenschaftliche Projekten aus allen klinischen, klinisch-theoretischen und grundlagenmedizinischen Fachbereichen sowie der Forschungsschwerpunkte Environmental Health Sciences und Medical Information Sciences. Auch interdisziplinäre Forschungsprojekte der Medizindidaktik/ Bildungsforschung werden unterstützt.
• Anträge, die die Beteiligung der Universitätsmedizin Augsburg in den Verbünden des Bayerischen Krebsforschungszentrums, der CCC-WERA-Allianz sowie des Deutschen Zentrums für Psychische Gesundheit (DZPG) oder auch der geplanten externen Graduiertenschule Trilogic sollen nachhaltig gestärkt werden.
• Anträge mit innovativen und relevanten wissenschaftlichen Fragestellungen aus allen Fachbereichen, die das Potential haben, in eine zeitnahe öffentliche Drittmitteleinwerbung zu münden.